Pulau Koumi, pulau yang indah di Samudra Pasifik. Di pulau itu, orang-orang melewati legenda lama turun-temurun bahwa ada Istana Dasar Laut, sebuah reruntuhan kuno di dasar laut, tempat harta karun dari 2 bajak laut perempuan, Anne Bonnie & Mary Reed (yang benar-benar ada 300 tahun) lalu), yang tersisa. Ketika Conan dan teman-temannya mengunjungi Pulau Koumi saat berlibur, mereka bertemu dengan beberapa pemburu harta karun. Ada sesuatu yang mencurigakan tentang mereka.