Omnimon menghadapi Mephistomon (yang dibentuk dari data Apocalymon) di sudut gelap Dunia Digital atas upaya Mephistomon untuk menghancurkan Dunia Digital dan Dunia Nyata dan menggabungkan data untuk menjadi benar-benar tak terkalahkan. Mereka bertarung, tetapi kemudian Mephistomon melihat peluang dan masuk ke Dunia Nyata.