Kiruru lain muncul di Pasifik Selatan, tetapi dikalahkan oleh dua entitas yang tidak dikenal yang terlihat seperti orang Keron, dengan perbedaan yang halus. Sementara itu, Keroro dan geng pergi untuk perjalanan disponsori oleh Momoka ke pulau pribadi. Di sana, alien bernama Meru, yang mengklaim dirinya sebagai pangeran laut dalam, menangkap mereka, dan bertujuan untuk membuat Natsumi sang puteri, dan bahwa mereka telah menangkap Keroro, yang memohon kepada mereka untuk membantu Keroro Platoon, hanya untuk ditendang di luar.