Setelah menyelamatkan nyawa pewaris mereka, Snake Eyes yang ulet dan penyendiri disambut ke dalam klan Jepang kuno yang disebut Arashikage di mana dia diajari cara-cara prajurit ninja. Tapi, ketika rahasia dari masa lalunya terungkap, kehormatan dan kesetiaan Mata Ular akan diuji – bahkan jika itu berarti kehilangan kepercayaan dari orang-orang terdekatnya.